Del vocablo CIHUALTEPETL, que significa "Cerro de las Mujeres, ahora rebautizado como El Cerro de las Mujeres Bellas
Según el historiador comayagüense Mario Felipe Castillo, "Siguatepeque no fue fundada, sino descubierta", para esa época había un pequeña población autóctona. Todo esto aconteció el 7 de diciembre de 1537, cuando el adelantado Alonso de Cáceres recorrió el poblado con sus huestes españolas, encontrando indígenas habitando en las faldas y sabanas aledañas al cerro Calanterique y en las orillas de los riachuelos Guique y Guaratoro.
Se han encontrado vestigios de sus aborígenes como utensilios, desde piedras de moler, vasijas, jarrones, ollas, objetos de adornos para sala, imágenes de ídolos de diferentes formas y tamaños, propios de los grupos étnicos maya y lenca.
Siguatepeque, según el padre Vallejo, fue fundada por indios de origen lenca por el año de 1689. Para 1788 formaba parte de un curato de seis cofradías y contaba con las siguientes aldeas: Jaitique, Meambar y Taulabé.